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Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具基本簡(jiǎn)介
Graphpad Prism 是一款優(yōu)秀的統(tǒng)計(jì)繪圖軟件,集生物統(tǒng)計(jì)、曲線擬合、科研繪圖于一體。軟件專門為科研工作者設(shè)計(jì),可以輕松地進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析并繪制統(tǒng)計(jì)圖,已被世界知名學(xué)府、科研機(jī)構(gòu)、醫(yī)學(xué)中心和制藥企業(yè)廣泛使用。Graphpad Prism 具有功能實(shí)用、操作便捷等特點(diǎn),自推出以來受到了很多用戶的喜愛,該軟件集生物統(tǒng)計(jì)、曲線擬合和科學(xué)繪圖于一體,可以幫助醫(yī)學(xué)人員輕輕松松就可以制作出專業(yè)的醫(yī)學(xué)表。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具軟件科普
非線性回歸是分析數(shù)據(jù)的重要工具,但往往比需要的難度更大。 沒有其他程序能像 Prism 那樣簡(jiǎn)化曲線擬合。 事實(shí)上,你通??梢栽谝粋€(gè)步驟中適合曲線。 只需從常用方程式的廣泛列表中選擇一個(gè)方程式(或輸入您自己的方程式),Prism 會(huì)自動(dòng)完成其余部分 – 適合曲線,以表格形式顯示結(jié)果,在曲線圖上繪制曲線,并插入未知值。將多個(gè)數(shù)據(jù)集的數(shù)據(jù)并排放置在有組織的數(shù)據(jù)表上,而 Prism 可以一次將所有的數(shù)據(jù)集合在一起。 您可以分別將相同的模型擬合到每個(gè)數(shù)據(jù)集,使用全局非線性回歸在數(shù)據(jù)集之間共享參數(shù)值,或?qū)⒉煌哪P蛿M合到不同的數(shù)據(jù)集。
麻雀雖小五臟俱全,Prism 也為您提供了許多先進(jìn)的配件選擇。它可以將最佳擬合參數(shù)的置信區(qū)間報(bào)告為非對(duì)稱范圍(P值相似方法),它比通常的對(duì)稱區(qū)間要精確得多。 它還可以自動(dòng)插入標(biāo)準(zhǔn)曲線中的未知值(即分析RIA數(shù)據(jù)),使用F檢驗(yàn)或Akaike信息準(zhǔn)則(AIC)比較兩個(gè)方程的擬合,繪制殘差,識(shí)別異常值,差異重量數(shù)據(jù)點(diǎn),測(cè)試正常性的殘差等等。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具軟件功能
數(shù)據(jù)組織:
采用結(jié)構(gòu)化、格式化的數(shù)據(jù)表概念,用戶需根據(jù)要?jiǎng)?chuàng)建的圖表或分析類型(如XY圖、柱狀圖、生存曲線等)選擇相應(yīng)的數(shù)據(jù)表格式。
這種設(shè)計(jì)使得數(shù)據(jù)組織清晰,直接對(duì)應(yīng)實(shí)驗(yàn)的分組和重復(fù)設(shè)計(jì),為后續(xù)統(tǒng)計(jì)分析和作圖打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。
統(tǒng)計(jì)分析:
內(nèi)建豐富的統(tǒng)計(jì)分析方法,包括t檢驗(yàn)、方差分析、非參數(shù)檢驗(yàn)、線性回歸、邏輯回歸、生存分析等。
軟件能夠自動(dòng)計(jì)算統(tǒng)計(jì)量、P值、置信區(qū)間等,并生成符合規(guī)范的統(tǒng)計(jì)結(jié)果表格和圖表。
引導(dǎo)用戶選擇合適的檢驗(yàn)方法,避免誤用統(tǒng)計(jì),并能自動(dòng)解釋結(jié)果。
圖表繪制:
提供大量高度可定制的科研圖表模板,如柱狀圖、折線圖、散點(diǎn)圖、箱線圖、生存曲線圖等。
用戶可以自定義圖片的各個(gè)細(xì)節(jié),如坐標(biāo)軸、標(biāo)題、圖例、刻度標(biāo)簽等,以得到漂亮的統(tǒng)計(jì)圖。
支持多種格式的圖片輸出,包括高分辨率的TIF格式和EPS格式,滿足發(fā)表文章的各種需要。
結(jié)果整合與輸出:
項(xiàng)目文件包含所有數(shù)據(jù)表、分析結(jié)果、圖表和注釋,方便用戶進(jìn)行項(xiàng)目管理和協(xié)作。
支持將多個(gè)圖表、結(jié)果表格、文本注釋組合排列在一頁或多頁上,形成完整的圖表結(jié)果展示頁。
可以導(dǎo)出單張或多張圖表為高分辨率圖片文件,或?qū)⒄麄€(gè)布局導(dǎo)出為PDF。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具特色
直觀易用:
界面友好,無需編程基礎(chǔ),降低學(xué)習(xí)門檻。
工具欄按鈕簡(jiǎn)潔明了,一鍵式操作,包含了所有的繪圖和分析功能。
統(tǒng)計(jì)嚴(yán)謹(jǐn):
內(nèi)建豐富的統(tǒng)計(jì)分析方法,自動(dòng)生成符合規(guī)范的統(tǒng)計(jì)結(jié)果。
在執(zhí)行統(tǒng)計(jì)分析時(shí),軟件會(huì)引導(dǎo)用戶選擇合適的檢驗(yàn)方法,避免誤用統(tǒng)計(jì)。
圖表精美:
提供大量高度可定制的科研圖表模板,輸出出版級(jí)圖片。
用戶可以根據(jù)自己的需要選擇最適合的圖表類型,以展示數(shù)據(jù)的關(guān)系和趨勢(shì)。
數(shù)據(jù)與圖表聯(lián)動(dòng):
修改數(shù)據(jù)后,圖表會(huì)自動(dòng)更新,避免重復(fù)勞動(dòng)。
這種聯(lián)動(dòng)性使得用戶可以更加高效地進(jìn)行數(shù)據(jù)分析和可視化。
兼容性好:
支持Windows和Mac操作系統(tǒng),滿足不同用戶的需求。
支持多種數(shù)據(jù)導(dǎo)出格式,方便與其他軟件(如Word、PPT)進(jìn)行數(shù)據(jù)交互和協(xié)作。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具安裝步驟
1、在華軍軟件園下載這款軟件的壓縮包,解壓后,雙擊exe文件,進(jìn)入安裝界面,點(diǎn)擊browse可以修改默認(rèn)在C盤的安裝位置,建議大家選擇安裝在D盤,然后點(diǎn)擊install
2、軟件正在安裝,我們耐心等待
3、軟件安裝成功,點(diǎn)擊finish即可
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具使用方法
1、數(shù)據(jù)的錄入
打開GraphPad Prism軟件后,軟件會(huì)讓操作者選擇數(shù)據(jù)的輸入類型,此時(shí)注意選擇“Column”這個(gè)選項(xiàng)。如圖2所示:
之后分別輸入兩組變量的值。如圖3所示,實(shí)驗(yàn)組共5個(gè)樣本,檢測(cè)數(shù)值分別為1,2,3,4和5;對(duì)照組也是5個(gè)樣本,分別是4,5,6,7和8。也可以在表頭上對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)識(shí),分別為Experiments和Controls。如果此處不進(jìn)行標(biāo)識(shí),默認(rèn)的組名是Dataset A和Dataset B。
2、結(jié)果的運(yùn)算
結(jié)果錄入完畢后,點(diǎn)擊菜單欄中的Analyze,會(huì)出現(xiàn)如圖4所示的界面。注意左側(cè)一定要選中”t tests (and nonparametric tests)”。
點(diǎn)擊圖4中的OK,會(huì)進(jìn)入如圖5所示界面。在此界面中,軟件要求作者選擇是否配對(duì)(Paired和Unpaired),并決定選擇參數(shù)檢驗(yàn)還是非參數(shù)檢驗(yàn)。所謂參數(shù)檢驗(yàn)就是指配對(duì)t檢驗(yàn)或獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),而非參數(shù)檢驗(yàn)則是指Mann-Whitney U檢驗(yàn)或配對(duì)Wilcoxon檢驗(yàn)。如果選擇參數(shù)檢驗(yàn)(默認(rèn)兩組數(shù)據(jù)均呈正態(tài)分布),軟件會(huì)讓操作者選擇方差是否齊。
如果方差齊,軟件會(huì)選擇t檢驗(yàn),如果不齊,軟件推薦Welch法。需要說明的一點(diǎn)是,如果兩組數(shù)據(jù)均呈正太分布,但方差不齊,此時(shí)應(yīng)采用校正t檢驗(yàn),目前有三種主要的校正t檢驗(yàn)法:Cochran & Cox法、Satterthwait法和Welch法。GraphPad Prism僅支持Welch法。
如果兩組數(shù)據(jù)不呈正太分布,則應(yīng)該選用非參數(shù)檢驗(yàn)。非參數(shù)的兩個(gè)選項(xiàng)分別是Mann-Whitney U檢驗(yàn)和Kolmogorov-Smirnov檢驗(yàn)。一般選擇Mann-Whitney U檢驗(yàn)。
除了Experimental Design以外,還可以對(duì)Optional選項(xiàng)里面的內(nèi)容進(jìn)行修改。如圖6所示。一般建議選擇“Discreptive statistics for each data set”(展示各組數(shù)據(jù)的均數(shù)、中位數(shù)、標(biāo)準(zhǔn)差、秩和等)選項(xiàng)。在P value一段,系統(tǒng)默認(rèn)為雙尾檢驗(yàn),一般建議不要更改。
所有的選項(xiàng)選擇完畢后,點(diǎn)擊OK即可進(jìn)行計(jì)算。
3、結(jié)果的解讀
結(jié)果一般分為兩個(gè)部分,一是差異是否具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;二是差異有多大。如果研究者選擇了Mann-Whitney U檢驗(yàn),則可得到如圖7所示的結(jié)果。
參數(shù)分析結(jié)果的解讀與此類似,只不過多了個(gè)F test to compare variances,即方差是否齊。一般認(rèn)為,P值大于0.10才可以認(rèn)為兩組數(shù)據(jù)方差相同(注意:是“大于”,不是“小于”!是“0.10”,不是“0.05”!!!!)。
4、檢驗(yàn)數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布
可能有的讀者會(huì)問GraphPad Prism能否判斷數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布。其實(shí)是可以進(jìn)行正態(tài)分布檢驗(yàn)的。以上述兩組數(shù)據(jù)為例,首先點(diǎn)擊Analyze,然后選擇XY Analysis下面的Column statistics。如圖8所示:
如圖9所示,GraphPad Prism提供了三種檢驗(yàn)數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布的方法:D’Agootino-Pearson法,Kolmogorov-Smirnov法和Shapiro-Wilk法。針對(duì)同一種數(shù)據(jù),三種方法的計(jì)算結(jié)果大同小異。雖然GraphPad Prism不推薦用Kolmogorov-Smirnov法,但根據(jù)筆者經(jīng)驗(yàn),在國(guó)際上發(fā)表論文時(shí),多采用Kolmogorov-Smirnov法的結(jié)果,可能是因?yàn)楫?dāng)樣本量太小時(shí),Shapiro-Wilk法和D’Agootino-Pearson法無法給出檢驗(yàn)結(jié)果。當(dāng)然,也可以三種方法都選擇,綜合判斷數(shù)據(jù)是否呈正態(tài)分布。
選擇好統(tǒng)計(jì)方法之后點(diǎn)擊OK,就可以得到正態(tài)檢驗(yàn)的結(jié)果,如圖10所示。需要特別說明的是:在正態(tài)檢驗(yàn)中,一般認(rèn)為P大于0.10才表述數(shù)據(jù)呈正態(tài)分布(注意:是“大于”,不是“小于”!是0.10,不是“0.05”!!!!)。在本案例中,兩組數(shù)據(jù)的P值均為0.20,因此可以認(rèn)為兩組數(shù)據(jù)均呈正態(tài)分布。
Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具常見問題
用Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具官方版軟件繪制散點(diǎn)圖及線性分析?
打開Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具官方版,將Y右側(cè)的第一欄選中,點(diǎn)擊create。
分別在X和Group A下方對(duì)應(yīng)的空白處輸入組別,并在X、Y下方輸入數(shù)據(jù)。
點(diǎn)擊Graphs下方的Data1,輸出圖片,選擇散點(diǎn)圖,點(diǎn)擊ok。
點(diǎn)擊Analyze,點(diǎn)擊線性回歸(Linear regression)。
點(diǎn)擊ok,彈出如下對(duì)話框,繼續(xù)點(diǎn)擊Ok,出現(xiàn)擬合好的直線圖。
繼續(xù)點(diǎn)擊analyze,開始進(jìn)行相關(guān)性分析。將線性回歸改成相關(guān)性(correlation)。
點(diǎn)擊Ok,彈出如下對(duì)話框,繼續(xù)點(diǎn)擊ok。在結(jié)果中可以看到散點(diǎn)圖的Pearson r 相關(guān)性以及P value大小。
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CorelDraw2020官方版是一款由Corel公司精心打造的全新型矢量圖形制作軟件,cdr2020便捷實(shí)用,可以讓您更加輕松地進(jìn)行矢量插圖、頁面布局、圖片編輯和設(shè)計(jì)等圖像處理操作,CorelDraw2020軟件功能強(qiáng)悍,能夠給用戶帶來全新的LiveSketch矢量圖繪制體驗(yàn)。
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Graphpad Prism棱鏡科研繪圖工具更新日志
1:優(yōu)化了性能
2:解決bug問題我們是認(rèn)真的
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