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OVITO軟件介紹
OVITO是一個針對原子和粒子模擬數(shù)據(jù)的科學可視化和分析軟件。它幫助科學家更好地了解材料現(xiàn)象和物理過程。該程序在開源許可下可在所有主要平臺免費使用。作為分析、理解和說明仿真結(jié)果的有力工具，它已在越來越多的計算仿真研究中發(fā)揮作用。
OVITO軟件特色
1. 消耗內(nèi)存小。相對于VESTA，VMD等軟件，消耗內(nèi)存小。導入大體系運行流暢。
2. 正則表達式。正則表達式功能使得OVITO對結(jié)構(gòu)的操作靈活自由。
3. 豐富的內(nèi)置函數(shù)。豐富的內(nèi)置函數(shù)使其具有強大的分析功能。
OVITO使用教程
【如何利用 OVITO找弗倫克爾缺陷】
利用 OVITO 找弗倫克爾缺陷對需要準備兩個文件：一個是結(jié)構(gòu)演化前的坐標文件，一個是結(jié)構(gòu)演化過程的坐標文件(這個是利用 LAMMPS 的 dump 命令進行輸出)。以我上次最后給出的演化示意圖的制作為例，一共用到了 OVITO 的十個功能，我在下方圖中標了出來。具體操作過程如下：
將演化過程的文件導入 OVITO 軟件后，選取下圖2中標注 1 處(Filecontains time series)，告訴 OVITO 該文件是個演化過程文件，隨后選擇下圖中標注 2 處(Add modification)，這里面幾乎包含了 OVITO 軟件的所有功能，有興趣的同學可以去探索一下。在圖2 中標注 2 處里面找到并選取 Wigner - Seitz defect analysis (這也是 NC 文章中所提到的缺陷分析方法);
接著點擊下圖 標注 5 處導入演化前的結(jié)構(gòu)文件。然后會在圖3 中標注 6 處發(fā)現(xiàn)軟件告訴你找到幾個空位和幾個間隙子(一般情況下這兩個值是相等的)，繼續(xù)點擊圖3 中標注 7 處(播放鍵)，OVITO 便會自動統(tǒng)計演化過程中每個時刻產(chǎn)生的空位數(shù)目和間隙子數(shù)目。
但是，NC 文章中的演化圖中只有空位和間隙子，并不是 Fe 原子 ~，繼續(xù)選取 Add modification 處，找到里面的 Expression select(圖4 中標注 8 處)，選取后 OVITO 會給你一個方框，在里面填寫 Occupancy==1 (這是告訴 OVITO 讓它將沒有離開晶格位置的 Fe 原子都選中)，然后在 2 處選擇 Delete selected particles(圖中標注 9 處)，讓 OVITO 將這些 Fe 原子都刪掉，這樣就只剩下空位和間隙子了，接著再次重復(fù)一下 Expression select 這個過程，選取 Occupancy == 2 或者 0 (這是告訴 OVITO 讓它將間隙子或者空位都選中)，然后在 Add modification 中找到 Assign color(圖4中標注 10 處)，給選中的空位或者間隙子賦予自己喜歡的顏色，隨后再次點擊播放鍵，OVITO 將為你展示完整的缺陷演化過程。至于圖2 中標注 3，4 這兩個地方，一個是輸出演化過程視頻文件，一個是輸出單張圖片。
【如何利用 OVITO 做類似 NC 文章中的位錯環(huán)分析】
由于本人重復(fù) NC 文章級聯(lián)碰撞過程使用的體系很小，所以根本形成不了位錯環(huán)，因此很干脆的在 Fe 當中手動的建了一個位錯環(huán)，這里再給各位安利一個建模軟件，Atomsk，一款金屬材料界建模利器(多晶，晶界，位錯以及界面等等)，有興趣的同學可以百度一下，以下是用 OVITO 展示了我用 Atomsk 建的一個 Fe 的位錯環(huán)(導入坐標文件后直接在 Add modification 中選取 Dislocation analysis(DXA)即可)：
可以看到 OVITO 不僅幫忙找出了位錯環(huán)，而且還能幫忙指出了幾個位錯環(huán)，各個位錯環(huán)的長度以及其伯格斯矢量(對應(yīng) NC 文章的 fig.3)。
OVITO更新日志
1.修復(fù)BUG，新版體驗更佳
2.更改了部分頁面
華軍小編推薦：
在經(jīng)歷了多次的更新與優(yōu)化，OVITO變得更加的人性化，也更加的簡單易操作，華軍軟件園小編親測，推薦給大家下載，感興趣的小伙伴還可以下載樂易集成吊頂設(shè)計軟件、原木材積計算器、廣東省企業(yè)所得稅申報系統(tǒng)、派爾玻璃優(yōu)化軟件、太友CPK計算工具。
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